Najważniejsze wnioski
- ✓Mostek dwusiarczkowy to wiązanie kowalencyjne między atomami siarki dwóch reszt cysteiny, które może zamknąć peptyd w pierścień.
- ✓Pierścienie są sztywniejsze i zwykle bardziej odporne na niektóre enzymy niż odpowiadający im łańcuch liniowy.
- ✓Utworzenie mostka usuwa dwa atomy wodoru, więc pierścień waży około 2 Da mniej niż forma otwarta.
- ✓W certyfikacie analizy zmierzona masa powinna odpowiadać formie cyklicznej, a nie liniowej.
Co czyni peptyd cyklicznym
Peptyd można cyklizować na kilka sposobów: łącząc jego oba końce, łącząc łańcuch boczny z końcem lub łącząc dwa łańcuchy boczne. Najczęstszą drogą w naturalnych hormonach jest mostek dwusiarczkowy między dwiema cysteinami.
Jak działa mostek dwusiarczkowy
Cysteina niesie grupę tiolową. Gdy dwa tiole ulegają utlenieniu, łączą się w wiązanie siarka–siarka. Oksytocyna to peptyd o dziewięciu resztach z mostkiem między pierwszą a szóstą, a oktreotyd ma jeden między drugą a siódmą.
Ponieważ wiązanie jest kowalencyjne, jest znacznie silniejsze niż słabe oddziaływania utrzymujące resztę kształtu peptydu.
Dlaczego badacze zwracają uwagę na pierścień
Pierścień ogranicza sposób, w jaki łańcuch może się zwijać. Może to poprawić wiązanie z receptorem i selektywność oraz chronić peptyd przed enzymami trawiącymi od końców.
Kosztem jest to, że sam mostek jest punktem podatności chemicznej. Czynniki redukujące mogą go przerwać, a peptydy z więcej niż dwiema cysteinami mogą tworzyć błędne parowanie.
Co to oznacza dla masy i czystości
Utworzenie mostka dwusiarczkowego usuwa dwa atomy wodoru, więc forma cykliczna jest o około 2 Da lżejsza niż otwarta, zredukowana forma. W spektrometrii mas to niewielkie przesunięcie jest oznaką prawidłowo zamkniętego pierścienia.
W HPLC mieszanina form otwartych, prawidłowo zamkniętych i błędnie sparowanych może pojawić się jako dodatkowe piki lub poszerzony pik, dlatego chromatogram warto czytać uważnie.
Na co zwracać uwagę w certyfikacie analizy
W przypadku peptydu pierścieniowego CoA ma sens tylko wtedy, gdy uwzględnia pierścień.
- Czy zmierzoną masę porównano z obliczoną masą formy cyklicznej?
- Czy ślad HPLC to pojedynczy czysty pik, czy są ramiona, które mogą być izomerami?
- Czy sekwencja w dokumencie pokazuje parowanie mostka dwusiarczkowego tam, gdzie peptyd go ma?
- Czy numer partii zgadza się z fiolką, którą trzymasz w ręku?
Gdzie kupić
Dlaczego kierujemy badaczy do Nordapep
Porównanie związków to tylko połowa pracy. Druga połowa to pewność, że fiolka zawiera to, co mówi etykieta. Nordapep publikuje dokumentację partii dla każdego sprzedawanego związku.
Zobacz katalog Nordapep →Numer partii na etykiecie odpowiada jej świadectwu, aby można było sprawdzić zawartość fiolki.
Wpisz numer partii z fiolki w narzędziu weryfikacyjnym Nordapep.
Czystość mierzona jest metodą RP-HPLC, standardem dla peptydów tej wielkości.
Zestawy do typowych porównań i ceny progowe przy większych ilościach.