Punti chiave
- ✓La carica netta al pH di lavoro è il primo indicatore di solubilità.
- ✓I tratti idrofobici riducono la solubilità in acqua.
- ✓Provate sempre prima una piccola porzione e seguite le indicazioni del fornitore per il prodotto specifico.
Contare la carica
Assegnate +1 a ogni lisina, arginina e all'estremità N-terminale libera, e -1 a ogni aspartato, glutammato e all'estremità C-terminale libera. Un peptide nettamente positivo tende a sciogliersi in soluzioni leggermente acide, uno nettamente negativo in soluzioni leggermente basiche. Il calcolatore di massa dei peptidi riporta carica e punto isoelettrico a partire da una sequenza.
Guardare il contenuto idrofobico
I peptidi in cui più di circa metà dei residui è idrofobica (leucina, valina, isoleucina, fenilalanina, triptofano) spesso resistono ai solventi acquosi e possono richiedere un cosolvente organico.
Il punto isoelettrico
I peptidi sono meno solubili vicino al loro punto isoelettrico, dove la carica netta è zero. Allontanare il pH da esso di solito aiuta.
Cautele pratiche
La documentazione del fornitore ha la precedenza sulle regole generali per un dato prodotto.
- Provate una piccola quantità prima di impegnare l'intera fiala.
- I residui soggetti a ossidazione (Cys, Met, Trp) possono limitare la scelta del solvente.
- L'aggregazione può sembrare torbidità; filtrate o scartate invece di presumere che si schiarisca.
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