Calcolatore di massa molecolare dei peptidi
Inserisci una sequenza in codice a una lettera. Serve a verificare la massa teorica che un certificato dovrebbe riportare o a confrontare analoghi.
- Lunghezza
- 15 residui
- Massa monoisotopica
- 1418,7041 Da
- Massa media
- 1419,55 Da
- Carica netta a pH 7,0
- -2,01
- Punto isoelettrico (pI)
- 3,68
- Coefficiente di estinzione (280 nm)
- Né Trp né Tyr: misura a 205 o 214 nm.
Si usano masse dei residui standard. Carica e pI sono stime da valori di pKa da manuale e possono differire da quelli misurati. Non sono inclusi residui modificati (catene di acidi grassi, D-amminoacidi, ciclizzazioni diverse dai disolfuri).
Domande frequenti
Che differenza c’è tra massa monoisotopica e massa media?
La massa monoisotopica usa solo l’isotopo più abbondante di ogni elemento e corrisponde al picco principale nella spettrometria di massa ad alta risoluzione. La massa media pesa tutti gli isotopi per abbondanza naturale ed è quella indicata dagli strumenti a bassa risoluzione e dalla maggior parte delle etichette.
Perché un’ammide C-terminale cambia la massa?
Sostituire l’–OH C-terminale con –NH2 riduce la massa di circa 0,98 Da. Molti peptidi sono ammidati, quindi l’opzione deve corrispondere alla molecola reale.
Quanto è preciso il pI calcolato?
È una stima basata su pKa da manuale. Il punto isoelettrico misurato può differire di mezza unità di pH o più, soprattutto per peptidi corti o molto modificati.
Strumenti per la ricerca sui peptidi
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La purezza è misurata con RP-HPLC, il metodo standard per peptidi di queste dimensioni.
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