Points clés
- ✓La charge nette au pH de travail est le premier indicateur de solubilité.
- ✓Les segments hydrophobes réduisent la solubilité dans l'eau.
- ✓Testez toujours d'abord une petite portion et suivez les indications du fournisseur pour le produit concerné.
Compter la charge
Attribuez +1 à chaque lysine, arginine et à l'extrémité N-terminale libre, et -1 à chaque aspartate, glutamate et à l'extrémité C-terminale libre. Un peptide nettement positif tend à se dissoudre en solution légèrement acide, un peptide nettement négatif en solution légèrement basique. Le calculateur de masse peptidique donne la charge et le point isoélectrique à partir d'une séquence.
Examiner la part hydrophobe
Les peptides dont plus de la moitié environ des résidus sont hydrophobes (leucine, valine, isoleucine, phénylalanine, tryptophane) résistent souvent aux solvants aqueux et peuvent nécessiter un co-solvant organique.
Le point isoélectrique
Les peptides sont le moins solubles près de leur point isoélectrique, où la charge nette est nulle. S'en éloigner en pH aide généralement.
Précautions pratiques
La documentation du fournisseur prime sur les règles générales pour un produit donné.
- Testez une petite quantité avant d'engager tout le flacon.
- Les résidus sensibles à l'oxydation (Cys, Met, Trp) peuvent limiter le choix du solvant.
- L'agrégation peut ressembler à un trouble ; filtrez ou jetez plutôt que de supposer qu'il disparaîtra.
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