Rechner für Peptid-Molekülmasse

Geben Sie eine Sequenz im Ein-Buchstaben-Code ein. So prüfen Sie die theoretische Masse, die ein Zertifikat angeben sollte, oder vergleichen Analoga.

Sequenz (Ein-Buchstaben-Code)

Beispiele:

N-terminale Acetylierung C-terminales AmidDisulfidbrücken

Länge: 15 Reste
Monoisotopische Masse: 1.418,7041 Da
Mittlere Masse: 1.419,55 Da
Nettoladung bei pH 7,0: -2,01
Isoelektrischer Punkt (pI): 3,68
Extinktionskoeffizient (280 nm): Kein Trp oder Tyr: stattdessen bei 205 oder 214 nm messen.

Es werden Standard-Restmassen verwendet. Ladung und pI sind Schätzungen aus Lehrbuch-pKa-Werten und können von Messwerten abweichen. Modifizierte Reste (Fettsäureketten, D-Aminosäuren, Zyklisierung außer Disulfiden) sind nicht berücksichtigt.

Häufige Fragen

Was ist der Unterschied zwischen monoisotopischer und mittlerer Masse?

Die monoisotopische Masse verwendet nur das häufigste Isotop jedes Elements und entspricht dem Hauptsignal in der hochauflösenden Massenspektrometrie. Die mittlere Masse gewichtet alle Isotope nach ihrer natürlichen Häufigkeit; sie geben niedrig auflösende Geräte und die meisten Etiketten an.

Warum verändert ein C-terminales Amid die Masse?

Ersetzt man das C-terminale –OH durch –NH2, sinkt die Masse um etwa 0,98 Da. Viele Peptide sind amidiert, daher muss die Option zum tatsächlichen Molekül passen.

Wie genau ist der berechnete pI?

Es ist eine Schätzung aus Lehrbuch-pKa-Werten. Gemessene isoelektrische Punkte können um eine halbe pH-Einheit oder mehr abweichen, besonders bei kurzen oder stark modifizierten Peptiden.

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