Przejdź do treści
Każdy związek prowadzi do zapasów badanych partiami w Nordapep, ze świadectwem analizy dla każdej partii.
peptide.wiki

Kalkulator masy cząsteczkowej peptydu

Wpisz sekwencję w kodzie jednoliterowym. Przydaje się do sprawdzenia masy teoretycznej, jaką powinno podawać świadectwo, lub do porównania analogów.

Przykłady:
Długość
15 reszt
Masa monoizotopowa
1418,7041 Da
Masa średnia
1419,55 Da
Ładunek netto przy pH 7,0
-2,01
Punkt izoelektryczny (pI)
3,68
Współczynnik ekstynkcji (280 nm)
Brak Trp i Tyr: mierz przy 205 lub 214 nm.

Użyto standardowych mas reszt. Ładunek i pI to oszacowania na podstawie podręcznikowych pKa i mogą różnić się od wartości zmierzonych. Nie uwzględniono reszt zmodyfikowanych (łańcuchy kwasów tłuszczowych, D-aminokwasy, cyklizacje inne niż mostki dwusiarczkowe).

Najczęstsze pytania

Czym różni się masa monoizotopowa od średniej?

Masa monoizotopowa uwzględnia tylko najobfitszy izotop każdego pierwiastka i odpowiada głównemu pikowi w spektrometrii mas wysokiej rozdzielczości. Masa średnia waży wszystkie izotopy według naturalnej obfitości; to ją podają urządzenia o niskiej rozdzielczości i większość etykiet.

Dlaczego amid na końcu C zmienia masę?

Zamiana C-końcowej grupy –OH na –NH2 zmniejsza masę o około 0,98 Da. Wiele peptydów jest amidowanych, więc ta opcja musi odpowiadać rzeczywistej cząsteczce.

Jak dokładne jest obliczone pI?

To oszacowanie na podstawie podręcznikowych wartości pKa. Zmierzony punkt izoelektryczny może różnić się o pół jednostki pH lub więcej, zwłaszcza w krótkich lub silnie zmodyfikowanych peptydach.

Narzędzia do badań nad peptydami

Wyłącznie do badań laboratoryjnych. Nic na peptide.wiki nie stanowi porady medycznej. Opisane związki nie są przeznaczone do stosowania u ludzi ani zwierząt, a materiał badawczy nie jest lekiem.